1、概念不同：全日制工学硕士是指参加份举行的全国硕士统一招考，录取后，经过全日制在校学习，属于工学学科分类的全日制研究生毕业，有硕士学位证书，学位证书上注名“工学硕士”字样。全日制工程硕士，是指参加份举行的全国硕士统一招考，录取后，经过全日制在校学习，毕业后有毕业证和学位证，毕业证与工学硕士相同。
2、教育体系：工程硕士（全日制）侧重于学术理论与实践；工学硕士侧重于学术理论与应用；工程硕士（非全日制）侧重于学术实践。工程硕士（全日制）与工学硕士属于统一教育体系，只是类型不同，而工程硕士（非全日制）属于不同教育体系。
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