爱斯基摩人属于亚洲民族，与美洲印第安人不同之处在于具有更多的亚洲人的特征，如手足较短小，此外，还有一些不太明显的区别特征。爱斯基摩人的另一与众不同之点是ABO血型中的B型人数之比例十分可观，而印第安人中几乎没有B型血型。由于血型是遗传特征中最为稳定的一个因素，现在学者们多认为，至少有一部分爱斯基摩人同印第安人族源不同，因而不能像早期学术界宣称的那样，把爱斯基摩人看作是单纯地另外发展于极北地带的一支印第安民族。此说更可证之于爱斯基摩是阿留申诸语言中因爱斯基摩人在地理上的广泛分布而存在大量方言这一事实。
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