1、繁殖方式不同：蟒蛇是卵生的，是将蛋产下后进行孵化，每次产卵数，卵为白色，孵化即破壳。而水蚰是卵胎生的，雌水蟒将受精卵保留在身体内直到孵化，每次可出生只小水蟒。
2、分布范围不同：蟒蛇是东南亚地区广布的物种，栖居于热带、亚热带低山丛林中，需要常绿阔叶林或常绿阔叶藤本灌木丛，以及良好的洞穴供休息及隐蔽。而水蚺生活在南美洲热带地区河流附近及其他水体中，主要分布于世界各地的沼泽地区。
3、身体长度不同：蟒蛇长度通常在左右，而水蚺的身体长度可达。
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