1、品种不同：三元猪属于外来杂交育种猪，一般都是杜长大杂交品种，基本都是白色皮毛，有个别是棕色；而太湖猪是本地品种，黑色戓者黑花色。
2、体型不同：三元猪体格长、大，长势较快，日增重平均左右；而太湖猪个头比较小，日增重一般不超过。
3、特点不同：三元杂种猪具有生长快、饲料利用率高、瘦肉率高、经济效益明显等特点，适宜大力推广；而太湖猪最大的特点就是繁殖力强、产仔率高，也因此而出名。
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